Мир микроорганизмов отличается чрезвычайным разнообразием. Микроорганизмы можно наблюдать и изучать только при помощи специального прибора — микроскопа. Величина их измеряется в микрометрах (мкм) К Микрометр составляет 1/1000 миллиметра. Величина вирусов измеряется миллимикрометрами (ммкм), равными 1/1000 микрометра, т. е.нанометрами.
Морфологию более крупных микроорганизмов (грибы, простейшие) изучают в световом микроскопе при увеличении в 100—400 раз, а таких мелких, как бактерии, спирохеты, риккетсии и некоторые простейшие,— при увеличении в 900—1000 раз. Изучение микроорганизмов в электронном микроскопе при увеличении в 50 000— 100 000 раз позволяет выявить детали строения микробной клетки.
Сведения об анатомии микробной клетки помогают определить функции некоторых морфологических структур на молекулярном уровне. Морфологию вирусов можно изучить только в электронном микроскопе.